中医体质辨识仪指出脏腑辨证论治是中医各种辩证论治的基础。其运用四诊八纲，结合脏腑的病理反映，来分析各种病症的过程。
肝与胆病辨证论治
中医体质辨识仪指出肝胆相表里，病因病机密切联系，肝阳上亢与肝风多由于肝肾阴虚，不能制阳，肝阳上亢或肝阳化风所致；肝气郁结多由精神情感抑郁所致，与六淫和痰也有关；肝血虚多由于出血或久病损耗营血；肝胆湿热多因脾虚运化失利，水湿久郁生热，湿热交结而致。
肾病辨证论治
肾病亦为临床常见病证，为长期损耗的虚证。肾阳虚由于素体阳虚，久病不愈或由劳损过度，下元亏损或因年老体弱所致。膀胱湿热多由于下焦湿久郁化热或外感湿热所致。
脾与胃病辩证论治
脾病为临床最多见得病证、其病因病机大致归纳为：脾气虚多由于身体虚弱、劳倦与饮食不节，内伤脾气而运化失调，出现消化营养紊乱；脾不统血，多由于脾虚而气不摄血，常可发生各种出血疾病；脾气下焰多由于中气不足失其提升作用而可出现内脏下垂；脾虚湿困多由于脾失健运，水湿内停所致；脾胃湿热多为湿久郁生热。胃热多由于外邪传内化热或过食辛辣厚味，或胃阳素强，胃寒多由于饮食不慎，受寒冷饮；胃阴不足，多由于高热伤津；食滞胃脘，多由于饮食不节，暴饮暴食，食滞不化所致。
心与小肠辨证论治
心病各证的病因病机比较复杂。心气虚，心阳虚多由于年老脏气日衰或由于其他疾病所致；心血虚、心阴虚多由于血的生化之源不足或续发于失血之后；心血瘀阻多因心阳虚、血脉阻滞所致；心火上炎，多因六淫内郁化火，或过服温补药等；痰迷心窍，痰火扰心多因精神刺激，国度思考所致。
肺与大肠病辨证论治
中医体质辨识仪指出肺气虚多由于久咳上气，或因脾虚、肾虚；肺阴虚多由于久病体弱，或邪热耗伤肺阴，或发汗太多；肺寒证、肺热证多由于外感风寒、风热、六淫之邪等所致。大肠湿热多由于饮食不节，过食生冷或不洁食物。
常见脏腑兼病辨证论治
中医体质辨识仪指出脏腑之间，生理与病理关系非常密切。一脏生理功能失调，可累及其他脏而产生脏腑兼病。
